郑家的东宁镇分两部分，一部分是泉州府，一部分台湾都司。泉州府当然是赚钱的府，财源广进，是东宁镇的“现金母牛”。但是台湾都司却是个无底洞，郑森每年往里面贴几十万，已经贴了20年，都没开发出多少。
因为台湾的商用价值实在不高，所以郑森只能用设置卫所的办法进行武装屯垦，设置了台湾都指挥使司，都司下面又设立了台中、台东、台南、台北四个卫，每个卫下又设了五个千户所，再下面的百户所。
另外，郑家在台湾都司的驻地，也就是原来荷兰人的热遮兰城建立了东宁市，作为台湾岛的中心城市。
经过20年移民开垦，现在台湾岛上的汉人军户（其实是武装农民）总数达到了将近三万六千户，口二十万有余——这个数目看着很少，但却是郑森多年努力，贴了几百万两银子的老本才经营起来的！
之所以如此艰难，主要原因有四个。
一是因为台湾岛上的热带疾病太厉害。
第二则是因为台湾也不是贸易中转站——这年头路过台湾海峡的各国商船都去泉州府的安平港或是厦门港停靠，没谁会去台湾的东宁港。
第三则是因为宝岛台湾上并没有什么宝，平原很少，特产就是鹿皮。
第四则是因为可以去的地方太多！
如果不怕痢疾索命，去金瓯军、暹罗国、西洋军、马六甲十二公国和淡马锡岛都不错啊，干嘛去台湾？