自那之后，绫波丽再也没有和李林私下接触过。
她就像是平常那样，作为EVA的驾驶员等待着，配合着治疗，即使零号机已经损毁也是一样。
这期间，发生了很多事情。
首先是李林消失了，没有任何理由, 但Nerv基地中有传言，失踪的当天，第三新东京市内曾经出现过枪击桉。
这个桉子并没有被大众所熟知，只是在Nerv中有着些许传闻。
但绫波丽却清楚，这一切八成都是真的。
奈欧斯的力量在这个世界是恐怖的，唯一一次看似竭尽全力也是因为两线作战的缘故, 而且，面对的敌人也是同样来自于异世界的存在。
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这种情况下, 想要决定人类命运之人自然会想尽办法的将奈欧斯排除在外。
但是，碇源堂应该不会贸然这么做，这样的做法太明显了。
那会是谁做的呢？
绫波丽不清楚，以她现在的认知能够思考到这一层已经是极限，虽然已经觉醒了被人类禁锢的记忆，但那些记忆对于她来说更像是远古洪荒时期留下的碎片而已，恍如隔世。
从没有学习过其他知识的绫波丽，即使是现在的状态，也心有余而力不足。
不过，现在的绫波丽，却诞生了新的困惑：
“为什么，你会这么宽容？”
是的，宽容。